В 1974г. закончил 1-й Московский медицинский институт им. И.М.Сеченова и был принят в аспирантуру Всесоюзного онкологического центра АМН СССР. После успешной защиты кандидатской диссертации работал там же младшим, а затем старшим научным сотрудником.
В 1987г. перешел на работу заместителем главного врача Московской гомеопатической поликлиники и прошел обучение по гомеопатии под руководством Д.Т.Липницкого, В.Г.Глаза и других врачей поликлиники. С этого времени вся деятельность В.С.Мищенко связана с этим учреждением, в котором он последовательно занимал должность главного врача, а с 1990г. по март 2014г. директора, созданного на базе поликлиники Московского гомеопатического центра.
С 1999г. Мищенко В.С. президент Российского гомеопатического общества. В течение многих лет член экспертного Совета по гомеопатии Минздравсоцразвития России. С 1991г.постоянный председатель Оргкомитета Московской международной гомеопатической конференции, в январе 2015г. состоялась XXV ММГК.
Автор более 100 печатных работ, посвященных различным проблемам современной медицины и гомеопатии.